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Question

The next section briefly discusses the basis for linkage methodology. This is followed by an account of family-based analysis, the development of the well-known transmission disequilibrium test (TDT) and other family- based approaches, and the emergence of combined linkage and association analysis. Linkage strategies are becoming particularly important now that genome-wide sequencing is being applied to small numbers of individuals. For example, in a recent article, a combination of linkage analysis and exome sequencing of a single offspring led to the identification of a single gene defect leading to T cell deficiency and subsequent Kaposi’s sarcoma . Family-based mapping methods have been –reviewed previously; here we consider their current –status, including newer developments .
Linkage-study designs
Because family-based designs enrich for genetic effects, studies based on familial cases have more power than unrelated cases to detect genetic effects given an equivalent number of sampling units . However, family collections are more laborious to acquire than case–control collections. The difficulty of obtaining collections for families depends on which of the many types of pedigree structure is chosen. Typical family designs include :（box1）parent–offspring trios; affected sibling pairs (sib-pairs); unselected sib-pairs or related individuals selected from the extremes of a quantitative trait distribution (for example, concordant or discordant sib-pairs); extended pedigrees with multiple affected individuals; consanguineous families; and families obtained from isolated populations. One of these designs, or a combination of them, may be chosen depending on the questions to be investigated. For example, a design involving concord-ant sib-pairs to map QTLs might be combined with unselected sib-pairs to establish the proportion of the heritability that is accounted for by the mapped loci.
Linkage studies rely on a statistical evaluation of the evidence in favour of the co-segregation of marker loci with a trait in one or more of the family designs outlined above. To do this, multiple techniques adapted to the particular study design or analysis goals may be required.

Answer 1

下个部分简单地谈论为连接方法学的依据。 这由基于家庭的分析帐户，知名的传输失衡测试(TDT)和其他家庭基于方法的发展和联合的连接和协会分析诞生跟随。 即然染色体范围内程序化被申请于很小数量的个体，连接战略变得特别重要。 例如，在一篇最近文章，连接分析和exome程序化的组合上一个唯一子孙导致导致T细胞缺乏和随后卡波西肉瘤的唯一基因缺陷的证明。 基于家庭映射方法是-以前回顾; 这里我们考虑他们的潮流-状态，包括新发展计划。连接学习设计由于基于家庭的设计为基因作用丰富，根据家族案件的研究比无关的案件有更多力量查出指定的基因作用抽样单位的一个等效数字。 然而，家庭收藏比情形控制汇集是费力获取。 得到家庭的汇集困难依靠哪些家谱结构的许多类型被选择。 典型的家庭设计包括：（box1）父母子孙三重奏; 受影响的兄弟姐妹对(sib对); 从定量特征发行的极端或相关个体挑选的未经选择的sib对(例如，一致或不和的sib对); 与多个受影响的个体的延长的家谱; 同族家庭; 并且从被隔绝的人口得到的家庭。 这些中的一个设计，或者组合的他们，也许根据将被调查的问题被选择。 例如，介入一致sib对的设计映射QTLs也许结合以未经选择的sib对建立占由被映射的所在地遗传能力的比例。连接研究依靠证据的一个统计计算倾向于标志所在地的co离析有一个特征的在被概述的一个或更多家庭设计以上。 要做此，多个技术适应特殊研究设计或也许需要分析目标。

Answer 2

第二部分简要论述了依据方法。连接这是继以帐户的分析家族企业的发展过程中,不知名的传输(TDT)测试和其他家庭-基础方法,并出现链和关联分析相结合。连接策略尤为重要,成为现在全基因组测序正被应用到少量的个人。例如,在一个最近的文章,结合连锁分析和exome次序的一个后代导致识别单个基因缺陷导致T细胞的不足和后续卡波西肉瘤。映射的方法已经被-reviewed家族之前,我们在这里看他们目前的地位,包括更新的发展。

Linkage-study设计

因为家族的遗传效应设计丰富,研究基于家族性的病例有更多的权力来检测遗传效应无关的情况下给予相同数目的抽样单位。然而,家庭更辛苦获得收藏品比对照收藏。收藏的困难家庭获得取决于其中的许多类型的血统结构被选中。典型的家庭设计包括:(box1)parent-offspring trios;兄弟对(sib-pairs)的影响,显示sib-pairs或相关个人选定的两极数量性状分布(例如,和谐或不协调的sib-pairs);扩展与多个受到影响的个人血统;密切的家庭;和家庭隔离人群得到。其中的一个设计,或它们的组合,可选择根据问题进行调查。例如,一个设计涉及concord-ant sib-pairs地图显示的数量可能结合sib-pairs建立的比例,是遗传性的映射位点所占的份额。

依靠连锁研究统计指标的证据支持co-segregation标记位点的这一特点,在一个或多个家庭设计在前面提到过。要做到这一点,多种技术适应特定的研究设计和分析的目标可能是必需的。