一文带你看懂蛋白质组学！看这篇就够了！

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基因对生物体的生、老、病、死起关键作用，基因研究称为基因组学，基因转录形成RNA，RNA翻译生成蛋白质，这个过程涉及蛋白质组学。蛋白质作为生物功能的执行者，连接生物学上下游，蛋白质组学随着质谱技术的发展，深入研究衍生出多种模式。蛋白质组学研究包括蛋白质表达、量变、翻译后修饰和蛋白间相互作用。

蛋白质组学可划分为：蛋白质定性、相对定量蛋白质组、全息扫描蛋白质组学、靶向蛋白质组学和微量蛋白质组学。

蛋白质定性（Shotgun法）：使用鸟枪法鉴定蛋白质混合物，通过质谱检测蛋白酶解后的肽段，二级质谱提供定性信息，实现蛋白质定性鉴定。应用包括蛋白胶鉴定、相互作用蛋白鉴定、全蛋白质组鉴定。

标记定量蛋白质组学（iTRAQ/TMT）：利用化学试剂标记蛋白质，实现定量，原理相似，但TMT标签可同时检测更多样本，提供更准确、可重复的定量结果，但不适用于蛋白质总量极低的样本分析。

非标记定量蛋白质组学（Label-free）：无需标记，每例单独检测，适用于临床大样本检测，能检测样本中蛋白质的绝对有无。

DDA与DIA：DDA选择性采集数据，优先检测丰度高的母离子，DIA全扫描，无遗漏地获取所有离子信息，提高蛋白检出率和定量准确性。

3D蛋白质组学 VS 4D蛋白质组学：4D添加离子淌度维度，区分m/z差值小的离子，提高扫描速度和检测灵敏度，提升鉴定深度和准确度，适合微量样本分析。

靶向蛋白质组学（PRM）：选择性检测目标蛋白质，实现定量，不依赖抗体，适用于大规模样本或蛋白质验证。

微量蛋白质组学：结合4D-DIA全息扫描技术，实现对珍贵、微量样本的深度蛋白质组学分析。

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