如何停止Discovery Studio 2.5任务（job）
Discovery Studio 2.5在运算过程中断电，重启后，任务一直显示running，但是没有完成进度提示，也无法停止。请问应该如何停止并退出该job，谢谢
如何停止Discovery Studio 2.5任务(job)
楼上基本正解，只不过说得简单了一点，我刚开始也没明白，后来试过了才发现有效。具体操作是右键单击我的电脑——管理——服务——scitegic_apache_7_5_2——停止， 然后会发现你的DS job由原来的“运行”状态变为“error”，这时候就可以选中job单击右键delete了，完成后再启动scitegic_apache_7_5_...
怎么用用discovery studio模建蛋白三维结构
首先，确保电脑上已经成功安装Discovery Studio2.5（下面简称DS2.5），我有一篇经验写怎么安装DS。DS界面如下，主要是用左侧第三栏的protocol协议 首先，打开待模建的序列，DS对文本格式要求较高，fasta文件要求首行>蛋白名，下面另起一行是蛋白序列， 打开待测序列文件， 接下来，先做序列比对，搜索...
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) 构建及优化组合化合物库...
步骤 1: 创建组合库 在Discovery Studio中，利用amines_35.sd、acids_45.sd数据文件与AmideFormation.rxn反应类型，创建组合化合物库。步骤 2: 设置帕累托优化参数 1. 选择反应类型作为库构建依据。2. 定义优化目标和参数，分别为分子多样性、分子量范围和氢键供体数目，从而确保库的多样性和理化性质的...
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) 构建基于受体-配体复合物药 ...
点击Background等待作业运行。 作业完成后,展开作业浏览器(Jobs Explorer)中该任务并点击Report链接,在Html窗口中打开Report页面。 结果分析在Report页面中点击Fits Organized by Molecule链接,查看1AJV与每个药效团模型匹配的FitValue值,所有药效团模型按fitvalue值由高到低排列。 FitValue值越高,说明1AJV与相应药效团匹...
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) 使用MCSS进行基于片段的分子...
步骤如下：在文件浏览器中打开1EQG.dsv，设置受体和结合位点后，双击1EQG-fragments.sd以查看两个片段。在工具浏览器中选择Dock Fragments (MCSS)，配置参数如输入受体、片段、并设置并行计算，然后运行任务。大约3分钟后，分析Dock Fragments(MCSS)任务的报告，查看Top Scoring Fragments in Cluster，以...
Discovery Studio 官方教程(Help-Tutorials)创建3D QASR模型
首先，确保你具备Discovery Studio Client和DS QSAR功能，以及trainingset.sd和testset.sd数据文件。模型构建过程涉及训练集分子的叠合，这是模型质量的关键。在Files Explorer中，分别双击这两个文件，查看已叠合的分子。在Tools Explorer中，选择Small Molecules | Create QSAR Model，点击Create 3D QSAR，...
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) 使用LibDock进行快速分子...
LibDock，以高效著称的分子对接技术，是Discovery Studio官方教程中的重要工具。本教程将通过实际操作，展示如何利用LibDock结合1kim_prot.dsv中的胸苷激酶和kinase_ligands.sd中的配体，进行快速的分子对接与结果分析，整个过程预计耗时约15分钟。在药物设计中，LibDock通过计算受体活性位点的热区图，引导配体分子...
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials)| ZDOCK介绍及教程_百度知 ...
如静电势能、范德华能、去溶剂化能等。5. 使用RMSD分析：将对接构型与1ppe的晶体结构叠合，计算结合界面氨基酸的RMSD值。6. 非键分析：评估蛋白-蛋白结合界面的非键作用特性，并提供相关表格文件。通过此教程，您将学会如何使用ZDOCK和RDOCK在Discovery Studio中进行蛋白对接实验，并分析对接结果。
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) ADMET预测药物代谢动力学...
包括以下内容：运行ADMET性质计算流程 1. 导入小分子化合物文件 在Discovery Studio的文件浏览器中，找到并双击打开包含20个丙酮酸盐激酶抑制剂的pk-test.sd文件。表格浏览器中将显示所选化合物。2. 选择计算性质，运行计算流程 在工具浏览器中，展开Small Molecules模块，选择Calculate Molecular Properties，...
Discovery Studio官方教程(Help-Tutorials) 基于MODELER构建蛋白酶模...
构建同源模型的第一步是基于序列相似性识别出一个或多个模板蛋白，通常采用BLAST程序从已知的蛋白结构数据库中完成此任务。序列比对和模板识别后，用户需选择合适的模板进行同源模型构建。本教程以胞外淀粉酶为例，展示如何在Discovery Studio中采用上述方法自动构建同源模型，并评估所构建模型，以直观了解...
