员工不定时工作制佣金和加班工资只能拿一样吗

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不是，一、何为不定时工作制？
不定时工作制，是指因生产特点、工作特殊需要或职责范围，无法按标准工作时间衡量、需机动作业而采取不确定工作时间的一种工时制度。根据法律规定，公司可针对企业生产特点、工作关系、岗位特性等因素，对公司高管、外勤人员、推销人员、部分值班人员或者企业中的长途运输人员、出租汽车司机和铁路、港口、仓库的部分装卸人员等，可以实行不定时工作制。
有效的不定时工作制，根据法律法规及社会实践，一般需满足如下条件：
第一，适用不定时工作制的企业，需符合企业的生产特性或岗位要求，同时需获得劳动行政部门批准。
第二，适用不定时工作制的企业，应提前在劳动合同内与劳动者约定，或事后通过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定后公示。
第三，适用不定时工作制的企业，应贯彻执行不定时工作制，以“不定时工作制为名”，实际执行标准工时制，可能面临“不定时工作制”被否认的结局。
二、哪些情形下，不定时工作制的企业仍需支付加班工资？
1、不定时工作制未获得行政部门审批且岗位不符合不定时工作制岗位特性的
案例1：陆某经用人单位安泰公司派遣至福洁公司，完成福洁公司美兰机场的相关工作，按照不定时工作制工作一天一夜休息一天一夜执行，后陆某要求解除劳动合同，支付加班费。根据劳动部《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》规定，地方企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制等其他工作和休息办法的审批办法，由各省、自治区、直辖市人民政府劳动行政部门制定，报国务院劳动行政部门备案。法院认为，安泰公司、福洁公司如认为公司所在岗位符合实行特殊工时制的条件，应报劳动行政部门审批同意方可实行。而现两公司均未提交其获得劳动行政部门审批同意实行特殊工时制的文件，应视为未获得审批，原告所在岗位按标准工时制执行，因此判决支持陆某加班工资支付的诉求。
2、不定时工作制未执行到位的
案例2：孟某与公司签订不定时工作制劳动合同，但公司要求其每周工作六天，周六的上班体现为加班，孟某正常工作时间为9：00-18：00，中午休息一个半小时，后孟某与公司发生劳动纠纷，要求公司支付加班费。法院认为，在不能执行以每日或者每周为节点统计工作时间的工作制度，并获得相应审批的情形下，可以实行其他工作制。公司虽然取得了《企业申请特殊工时工作制行政许可决定书》，但孟某实际工作时间为每周工作六天，每天工作7.5个小时，仍是以每日或每周为节点统计工作时间，公司未采取有效制度措施确保劳动者休息，双方约定的不定时工作制并未实际履行，故公司以不定时工作制不支付加班费的上诉理由，本院不予采信。
3、不定时工作制获得审批，但具体岗位未获得审批的
案例3：顾某在金旺包装公司担任营销中心总监助理工作，后双方发生劳动纠纷，顾某要求公司支付日常每天两小时及每周一天的加班工资。法院认为，不定时工时制度下劳动者在休息日和法定节假日工作的，不支付加班工资。结合金旺包装公司提交的人社局发布的批复，自2014年5月14日起，金旺公司实行不定时工作制的岗位中才包括销售员。金旺公司主张2013年起对销售员即实行不定时工作制，但其未依法履行审批手续，仍应认定2014年5月14日前，销售员实行标准工时工作制。但销售员的工作岗位具有不定时工作制的特点，顾正锁主张按照标准工时每周计算加班工资明显不合理。根据实际情况，法院酌定金旺公司应支付顾正锁加班工资37816.09元（（12500元÷21.75天÷8小时）×8小时×47周×2×70%）。对于某主张2014年5月14日之后的周六加班工资，法院不予支持。