事业单位聘用制也叫正式编制人员，临时工也叫合同制人员，两者主要的区别：
1、工资开支来源：正式编制人员工资由财政拨款解决；合同制人员工资由单位预算外收入中解决。
2、福利待遇：正式编制人员的福利待遇按政策规定及上级部门规定执行；合同制人员参照正式编人员标准执行，但实际上低很多或缺项。
3、正式编人员可以在事业单位之间调动；合同制人员不能。
4、正式编制人员可以提任副科级职务；合同制人员不可以。 事业单位聘任制干部是没有编制的，类似于合同制职工，但福利待遇肯定是按照事业单位的，如果是公务员单位里的聘任制，如法院的聘任制书记员职位，那是按照公务员的待遇。
5、合同制人员随时会被辞退；正式编制人员如无错误必须要工作满合同年限才能辞退。正式编制人员一般一签就是3到5年的工作时间。
6、正式编制人员需要每年去人事局缴纳人事代理费用；合同制人员不用。
事业单位聘用制是指事业单位直接和工作人员签订聘用合同，来确定双方聘用关系，明确双方权利、责任、义务的一种人事管理制度。
临时工就是事业单位中没有在编制内人员，这些职工大多是通过劳务派遣的方式，来签订劳动合同的。
二者区别如下：
1、法律依据不同
事业单位聘用制是指事业单位与工作人员通过签订聘用合同，确定双方聘用关系，明确双方责任、权利、义务的一种人事管理制度。
临时工，即事业单位中的非在编人员，也就是属于临聘人员，这部分职工一般是采取劳务派遣形式，签订的是劳动合同。
2、与单位关系不同
事业单位在编人员签订聘用合同，与单位确立人事关系，受《事业单位在编人员管理条例》管理。
事业单位临时工不签定任何合同，管理无依据。
3、薪资待遇不同
事业单位聘用制人员除了财政拨款，还享受各种津贴和补助。
临时工薪资待遇相对较低。
4、工资来源不同
事业单位聘用制人员工资由财政拨款解决，而临时工工资主要由事业单位自己发放。
5、福利待遇不同
事业单位聘用制人员的福利待遇按政策规定及上级部门规定执行，享受三金五险。而临时工不享受该待遇。
6、解聘方式不同
事业单位与工作人员订立的聘用合同，期限一般不低于三年。事业单位工作人员连续旷工超过15个工作日，或者一年内累计旷工超过30个工作日的，事业单位可以解除聘用合同。
临时工可以和事业单位随时解除关系。
7、职业前景不同
事业单位聘用制人员可以提任副科级职务，临时聘用人员不可以担任行政职务。
参考资料来源：百度百科-临时工
本回答被网友采纳事业单位临时工和聘用制主要有六个方面区别，分别是法律依据不同、与单位关系与要求不同、工资来源不同、职业前景不同、福利工薪待遇不同、解聘方式不同这六个方面。
（一）法律依据
临时工就是事业单位中没有在编制内人员，这些职工大多是通过劳务派遣的方式，来签订劳动合同的。事业单位聘用制是指事业单位直接和工作人员签订聘用合同，来确定双方聘用关系，明确双方权利、责任、义务的一种人事管理制度。
（二）单位关系与要求
事业单位临时工不用签定法律合同文件，管理是没有任何依据的。然而，事业单位编制人员是签订了劳动合同，与单位确立人事关系，受《事业单位在编人员管理条例》管理。
事业单位聘用工作人员，必须在确定的编制数额和人员结构比例范围内进行。事业单位实行聘用制，应当根据工作需要，按照科学合理、精干效能的原则，确定专业技术人员、管理人员和工勤人员岗位，按岗聘用，竞争上岗。
（三）工资来源
事业单位聘用制人员工资由财政部拨款解决，而临时人员工资主要由事业单位自己发放。
（四）职业前景
事业单位聘用制人员可以提任行政职务，临时聘用人员不能担任行政职务。临时聘用人员试用期满合格者要签订正式的劳动聘用合同，到期可续签，档案挂在人才中心而不是人事局。
（五）福利工薪待遇
事业单位聘用制人员的福利待遇按政策规定及上级部门规定执行，享受三金五险。事业单位聘用制人员除了财政拨款，还享受各种津贴和补助。临时工薪资待遇相对较低。而临时工不享受该待遇。
（六）解聘方式
临时工可以和事业单位随时解除关系。事业单位的临时工都是用用人单位签订的劳动合同，或者是与派遣公司签订的劳务派遣合同，这种合同属于劳动合同法规范的合同，如果合同到期用人单位提出不续签劳动合同，则双方的劳动关系解除。
事业单位与工作人员订立的聘用合同，期限大多不低于三年。事业单位工作人员若连续旷工超过15个工作日，或者累计一年内旷工超过30个工作日的，事业单位可以立即解除聘用合同。
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