历史上一直隶属于陕西省武功县．随武功变更而变更．
1983年武功县杨公社，杨陵镇和扶风县五泉公社成立新的杨陵区，隶属咸阳市。
1997年杨凌示范区成立时，考虑到投资者的心理问题，也寓意示范区志向高远，就将“陵墓”的“陵”改成了“壮志凌云”的“凌”。（另一种说法是领导人在给示范区的题词中写成了别字“凌”，最后迫不得已中而“急中生智”，以此作为了其改名的“合理”解释。）
国务院在设立杨凌示范区的批复中确定：杨凌示范区采用省部共建的领导和管理体制，由国家20个部委和陕西省共同管理和建设。杨凌示范区享有地市级行政管理权、省级经济管理权及部分省级行政管理权。享受国家级高新技术产业开发区的各项优惠政策、国家对农业的倾斜扶持政策以及西部大开发的各项优惠政策。
杨凌示范区成立后原属咸阳市的杨陵区划归示范区管理和领导，但在行政区划上仍属咸阳市。从政府这个层面上，杨陵区和咸阳市已经完全脱钩了，但是直到现在，杨陵区政府发的文件仍然用的是“咸阳市杨陵区人民政府”的印章。“严格意义上示范区管委会本身不属于一级政府，示范区没有设立法院和检察院，杨凌示范区内的相关事宜归杨陵区法院和杨陵区检察院处理，而这两家单位的上级单位是咸阳市中级人民法院和咸阳市人民检察院。”
“杨凌”、“杨陵”的这种交叉与混淆，不只是存在于普通老百姓当中，在杨凌示范区管委会和杨陵区政府的工作人员，有许多也说不清楚两者的区分。“示范区的面积94平方公里，管辖范围与下辖的杨陵区完全重叠。像这种情况在全国恐怕绝无仅有。”由于体制上还没有完全理顺，“凌”、“陵”经常会给人产生困惑，对此，杨凌示范区表示，管委会一直努力推动解决杨凌示范区的行政区划问题，“凌”与“陵”总有一天会统一。
杨凌因隋文帝杨坚的陵墓泰陵而得名。之前一直叫杨陵，现在叫杨凌。为了发展需要将“陵”改为了“凌”，取壮志凌云之意。但是也出现了很多问题，比如之前叫杨陵虽然有些阴气，但是可以让人感觉像个城市名字。而杨凌虽然好听了一点，但给人感觉像一个人名，而不像一个城市的名字。所以杨凌这个名字也没有给当地带来很多的发展，反而当地居民和外界对杨凌的命名接受度都不高。
关于杨凌的未来，有很多人建议将杨凌改为邰城。这个方案不现实，也违背历史，更不符合当今时代。因为据《史记·周本记》记载，公元前21—16世纪为邰氏部落故地，邰城是邰氏的部落故地名称，我们可以说邰姓氏族在这里生活过，我们现在的杨凌有邰城的历史，但不能说我们就是邰城，这样损害了邰氏的历史，也损害了其它姓氏在杨凌生活的归属感，也更加不利于当今时代的杨凌自身历史与文化的发展，现在的杨凌是包含着古邰国文化，邰城历史，后稷文化，隋唐文化，关中文明，一个拥有深厚历史文化底蕴的城市，不能单一的说杨凌是邰城。
杨凌有自身的历史脉络和文化渊源，有一条自己的城市发展史。4000多年前，中国历史上最早的农耕始祖—后稷在此辅佐大禹，教民稼穑，树艺五谷，杨凌成为中国农业发祥地之一。汉时杨陵属扶风管辖、魏时归武功郡、晋改名为平郡、北周时为雍州属地、唐代设稷州、宋初属武功归京兆府管辖、后改属醴州、金时属武亭县、元明两代为乾州属地、清属武功。新中国成立后，依据隋文帝杨坚的陵墓泰陵而得名，杨陵行政隶属关系变化频繁，但名称一直叫做杨陵，直到1997年，因陵字不利于发展，江主席题字变更为杨凌，并沿用至今。杨凌的名字是伴随着新中国的成立不断发展而来的，所以有着一定的文化基础与新时代意义，不建议大动现有的名称，但由于杨凌与人名太过相似，没有城市归属感，很多人提议进行微小变动，变更为“扬凌”，“扬”有上升，提高，发展之意，也取“发扬光大，壮志凌云”的寓意，即符合“杨陵”与“杨凌”的谐音，又含有将农业与当地经济文化发扬光大之意，更具有壮志凌云大力发展国家农业示范区带动当地发展的远大志向。并且将“杨”字的木字旁变更为“扬”字的提手旁，更能代表劳动，代表社会主义与共产主义，代表团结的双手，代表人民勤劳的双手，而木子旁仅仅只能代表植物，代表农作物，是静态的客观事物，而非主动的发展，提手旁更有一种积极向上的力，靠双手奋发向上，靠双手创造幸福，靠双手发展农业，农业是本地区的传统文化历史，用勤劳的双手发展农业，“扬凌”更加贴合历史，贴合城市自身属性，即尊重了历史，也符合了文化寓意。综合历史脉络，文化寓意，对于杨凌来说，比较适合的方案是“扬凌”。这样也可以形成一种“南有扬州，北有扬凌”的局势，打造一个西北地区自然优美，风景宜人的农业特色花园城市。
