中山大学有8个医学类的二级国家重点学科:药理学、内科学(内分泌与代谢病、肾病)、神经病学、外科学(普外)、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、卫生毒理学;1个医学类的二级国家重点(培育)学科。2012年教育部学科评估中,中山大学基础医学一级学科获得第5名,临床医学一级学科获得第4名,口腔学科一级学科获得第5名,公共卫生与预防医学一级学科获得第5名,药学一级学科获得第10名,护理学一级学科获得第8名。上海交通大学有5个医学类的二级国家重点学科:儿科学、内科学、外科学、口腔临床医学、病理学与病理生理学内科学。2012年教育部学科评估中,上海交通大学基础医学一级学科获得第3名,临床医学一级学科获得第1名,口腔医学一级学科获得第2名,公共卫生与预防医学一级学科获得第5名,公共卫生与预防医学一级学科获得第10名,药学一级学科获得第10名,护理学一级学科获得第5名。综合比较,上海交通大学的医学更强一些。
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