脚本主要是要解压一个大文件,然后再读取内容,处理后输入另一个文件中,要解压的zip文件有几十个G,我用的代码主要是这样的:
open( $FH, "gunzip -c $FN_fq_gz|" ) or die( "Cannot open file: $FN_fq_gz\n" ); #打开文件FH 写入文件FH_out 写入文件FH_unpair
open( $FH_out, "| gzip -c > $FN_fq_out" ) or die( "Cannot write to file: $FN_fq_out\n" );
open( $FH_unpair, "| gzip -c > $FN_fq_unpair" ) or die( "Cannot write to file: $FN_fq_unpair\n" );
这种解压方式在多个脚本同时操作的时候会发生内存不足,请问有没有什么办法能避免使用更多的内存?可以用Linux的命令。
下面的代码是用while(<$FH>)来读取每一段内容的,主要是换一种方式打开这个压缩文件,寻找能节省内存的办法。
高手来,我有个Perl脚本,要解压大文件,内存不足怎么优化?
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