综合性的分支学科有综合自然地理学、区域自然地理学、古地理学和历史自然地理学等。
部门性的分支学科有地貌学、气候学、水文地理学,土壤地理学、生物地理学、冰川学、冻土学、化学地理学和医学地理学等。
地貌学又称地形学,是研究地球表面的形态特征、成因、分布及其演变规律的学科,是自然地理学与地质学的边缘学科。
气候学是研究气候特征、形成、分布和演变规律,以及气候与其他自然因子和人类活动的关系的学科,是自然地理学与大气科学的边缘学科。
水文地理学,研究地球表面各类水体的性质、形态特征变化与时程分配,以及分布规律的学科,是自然地理学与水文学的边缘学科。
土壤地理学是研究土壤与地理环境的关系的学科,是自然地理学与土壤学的边缘学科。
植物地理学是研究植被空间分布规律的学科,是自然地理学与植物学的边缘学科。
动物地理学是研究动物在地璋表面的分布及其生态地理规律的学科,是自然地理学与动物学的边缘学科。
以独特的自然综合体或自然地理环境的某一方面为研究对象的分支学科有:
冰川学是研究地球表面各种自然冰体的形成、特征、发育及其分布规律的学科。
冻土学是研究冻土的形成、特征、发育及其分布规律的学科。
化学地理学是研究地理环境的化学组成和化学元素的分布、迁移转化规律的学科,是自然地理学与化学的边缘学科。
医学地理学是研究人群疾病和健康状况的地理分布、与地理环境的关系,以及医疗保健机构和设施地域合理配置的学科。它既是地理学与医学的边缘学科,也是应用地理学的分支学科。
此外,还有环境地理学、海洋地理学、荒漠学、河流学、沼泽学等分支学科。
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