1、为了保持清洁。苍蝇那么脏，还要保持自己清洁吗。确实是这样的，苍蝇到处飞，身上就会粘很多脏东西。这些东西如果不去除，那么苍蝇飞行的时候就会觉得有点重，就会影响苍蝇的飞行。
2、跟苍蝇的味觉系统有关系。我们人的味觉系统在舌头上，如果我们需要知道某种食物是什么味道。
3、为了传播共生细菌。苍蝇经常在垃圾堆臭水沟之类很脏的地方爬来爬去，它的脚就在脏东西上来回蹭。
原因一
苍蝇没有鼻子，但是，它有另外的味觉器官，并且还不在头上脸上，而是在脚上。只要它飞到了食物上，就先用脚上的味觉器官去品一品食物的味道如何，然后，再用嘴去吃。因为苍蝇很贪吃，又喜欢到处飞，所以见到任何食物都要去尝一尝，这样一来，苍蝇的脚上就会沾有很多的食物，这样既不利于苍蝇飞行，又阻碍了它的味觉。所以苍蝇把脚搓来搓去，是为了把脚上沾的食物搓掉。 因为苍蝇有这种坏习惯，所以会传染很多病菌。苍蝇如果在粪便、污水里站过又飞到食物上去，就会把病菌留在食物上。另外，苍蝇还有个更坏的习性，就是当它落在食物上时，不仅吃食物，而且，还要排粪，把肠子里的一些活着的病菌、寄生虫卵等等都排在食物上。如果人们吃了这样的食物，很容易感染上疾病，影响身体健康，甚至危及生命。 另外，美国在1986年拍摄了一部科幻恐怖片- 《变蝇人》（The Fly）。1989年拍摄了续集《变蝇人II》，讲述的是一个科学家身上有了苍蝇的基因后发生突变而发生的一系列的事情。 另外，应该还有种壮阳药也叫“苍蝇”。
原因二
每当苍蝇飞到脏物（如粪便、垃圾、腐败的动物尸体等）上空时，都会降落在上面，在上面爬来爬去，用自己的脚在上面蹭来蹭去，把上面的细菌粘附在自己的脚上，脚上就粘有大量细菌。 当苍蝇完成这一任务时，就会重新起飞，然后落在人类的食物上，开始搓脚，把脚上的细菌搓下来，细菌就会落在食物上，细菌的传播过程就完成了。当人吃下这些食物时，细菌就会进入人体，并寄生在人的体内。苍蝇对细菌的生存有利，为细菌提供了生存的条件。苍蝇和细菌属于共生关系。
我们发现不只是苍蝇的前脚与前脚对搓，后脚与后脚也会对搓，并且中脚与中脚没有对搓，而是与前脚或后脚搓，有时苍蝇还用脚搓头部、擦口器和掸翅膀。苍蝇到处活动，身上沾有许多脏物质，如果这些物质不清除，会增加苍蝇的体重，影响飞行，沾了东西后它的手和脚上的吸盘在降落的时候吸附在物体表面，停下来了也不容易很快的行走，所以苍蝇为什么总会不停的搓手和脚
另外，苍蝇搓脚同时也是为了清除脚上沾着的食物等东西，保持脚的清洁。否则不仅影响飞行、爬行，还会使它脚上的味觉器官失灵。也就是说，苍蝇搓脚是为了使脚清洁，保持它飞行、爬行和味觉的灵敏性。
综上所述就是苍蝇为什么要搓脚的原因
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苍蝇是完全变态的昆虫，它的生活史可分为卵、幼虫（3个龄期）、前蛹、蛹、成虫几个时期。苍蝇的寿命虽然只有1个月左右，但其繁殖力很强。苍蝇的食性非常复杂，属于杂食性蝇类，可以取食各种物质。
