学习SCI论文绘制技巧(C)

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当你在科研文献中欣赏到引人入胜的图表时，是否也想掌握如何用R语言绘制出这样的作品呢？本文将带你深入了解如何制作第三幅图——两组数据的带抖动点箱线图。这种图形在许多研究中用于比较不同估计方法的性能，虽然基础，但数据预处理是关键点。

第一部分是代码和数据的准备。首先，我们需要导入必不可少的R包，以及为后续绘图设置统一的主题。这部分内容在之前的推文中已详细介绍，完整代码可以在GitHub项目marco-meer/scifig_plot_examples_R中找到。

导入数据是下一步，通过read.csv函数，我们能看到数据大致结构。这里的数据分为trachea_length数值型和type、dev_stage的分类数据。整理数据时，可以考虑使用tidyverse包，如data.frame和rep函数，或者参考《R语言教程》和R数据科学文章。

下面是绘图的核心步骤。基础版本中，运用geom_boxplot和geom_point配合position_jitterdodge技巧，让图形有层次感，通过alpha设置透明度。为了优化视觉效果，我们还调整了x轴标签、填充颜色和主题。my_theme函数在此过程中扮演重要角色，但具体代码将在文末提供。

最后，本文的核心知识点包括：R包的加载，主题设置，数据导入和处理，以及如何通过geom函数创建箱线图和散点图。想深入学习的朋友，记得参考GitHub项目、ggplot2官方文档和《R语言教程》等资源。