通过中介进的工厂,由中介发工资吗

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视情况而定。
如果是跟工厂签订的劳动合同，应该由工厂发放工资、缴纳个税和社医保，常规中介向双方收取中介费；
如果是跟中介签订合同，通过劳务派遣方式至工厂上班，一般由中介发放工资。
注意劳务派遣合同应不少于两年。劳务派遣是工厂把工资给到中介机构,中介机构给发工资,没有和工厂签订劳动合同,只和中介有关,所以工厂不能直接发钱。如果未及时发放工资，可以打12333投诉或申请仲裁，注意保留劳动关系事实证据。
员工工资往往有很多因素，基本工资加上绩效工资等变动很大，所以要根据公司提供的工资表等进行核对。
总而言之，走不走中介要看你们签的什么合同,工厂直招就是我们常说的劳动合同.这种合同对工人的利益保护要多的多,走中介一般是劳务派遣合同,这种合同法律意义上你是和中介公司是合同关系,和工厂关系不大,也就是说你只和中介有法律关系.所对工人利益没什么保护.最好是签劳动合同.不要签劳务合同。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第九百六十一条
中介合同是中介人向委托人报告订立合同的机会或者提供订立合同的媒介服务，委托人支付报酬的合同。
第九百六十二条
中介人应当就有关订立合同的事项向委托人如实报告。中介人故意隐瞒与订立合同有关的重要事实或者提供虚假情况，损害委托人利益的，不得请求支付报酬并应当承担赔偿责任。