为什么我跑步跑不了多久，前脚掌与脚趾之间有个凹陷，前脚掌的肉就会被往脚趾推，肉被推平了，感觉很不舒

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根据你的描述，我觉得主要的问题是跑鞋的选择或者跑姿有问题，这两种情况都会导致脚部的问题。
第一，先谈谈跑鞋
正常短跑的话，跑鞋要选的和脚一样大或者稍微有点小(比较紧凑)，小的前提是你的脚要完全能展开。
短跑像100米，200米，400米之类都是按秒计算，非常短的时间内就完成了，虽然会产生大量的热量，但是跑完就可以把鞋子脱了，包裹性和抓地能力要比透气性重要的多。
长跑则相反，透气性要比包裹性更重要。
所以长跑或者马拉松的时候，选的鞋子一定要和脚一样大或者大一指。然后是透气性和回弹要非常好，不然跑一会儿脚就受不了，温度一高脚就会出问题。
根据你的描述，如果是鞋子的问题，我认为你的鞋子可能有点小，挤脚。而且鞋子的倾斜角(后跟高前掌低)有点大，你看看你的鞋子，如果没有这个问题，如果没有，那么看看下面。
第二，跑姿
短跑一般都是前脚掌着地，步频快，步幅大，脚踝会承受比较大的压力，每次脚着地的时候都有强烈的向前冲击感。
长跑或者马拉松则一般采取全掌着地(部分有也前掌，初学者建议后脚跟先着地)，这样的目的就是把脚踝和膝盖的压力降低到最低。
你检查一下自己的跑姿，然后再结合一下跑鞋，应该可以找到问题所在。
我长期跑马很多年，有跑步问题可以随时交流。