生物信息学PLoS计算生物学 BMC生物信息学 三个比较有名的和专门的生物信息学期刊。
一些知名的，但没有具体的生物信息学，只是很多bioinfo被发送到了上面。 核酸研究 基因组生物学 基因组研究 BMC基因组学 BMC系统生物学 BMC结构生物学 蛋白结构Bioinformatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。2012年度IF=5.468 另外还有Briefings in Bioinformatics，这个杂志每年的发稿量少，最近几年IF波动很大，第一年24+，后来到9+，2012年度IF=5.202。 稍次一点的杂志，如BMC Bioinformatics本回答被网友采纳
生物信息学100个基础问题——第1~ 5题 答案公布
1. FASTQ与FASTA格式 FASTQ包含4行：第1行包含测序坐标信息，第2行存储碱基序列，N代表未知碱基；第3行通常为空，第4行是质量信息，对应碱基质量得分。 Phred值用于评估测序质量，例如，P=1%对应Q值为20（Phred+33编码），质量越高，Phred值越大。 2. FASTA格式 FASTA用于存储单一序列，如蛋白...
小L生信学习日记-2丨生信入门必知背景知识
转录组测序转录组测序（RNA-Seq）利用二代高通量测序技术获取特定器官或组织在特定状态下的转录本信息，包含mRNA、非编码RNA等。分析后可揭示基因表达特征。生物信息数据库生信分析离不开生物信息数据库，覆盖生命科学各领域，如核酸序列数据库、蛋白质序列数据库、文献数据库等。以上是本期“生信入门必知背...
生物信息学100个基础问题——第1~ 5题 答案公布
FASTQ格式存储测序数据，特点包括：第一行记录坐标信息，第二行是测序序列，第三行空行，第四行存储质量信息。phred值评估测序质量，Phred+33和Phred+64表示不同的ASCII转换规则。单纯序列用FASTA，测序数据用FASTQ。第2题：测序技术初探 Sanger测序基于DNA复制原理，通量低因凝胶电泳时间长。Illumina测序（第...
chapter1.高通量序列实验简介:设计与生物信息学分析
6、Lane : Flowcell 由8个物理分离的通道组成,称为 Lane 。在所有 Lane 上并行进行测序。 7、Multiplexing\/Demultiplexing :在同一 Lane 上对几个样本进行测序称为多路复用 Multiplexing ,在一条 Lane 上测序的 Reads 的分离称为分路复用 Demultiplexing ,通过一个识别每个Reads*的索引将其与已知样本的索引进行比较。
什么是barcode?什么是index?
barcode和index是同一段核苷酸序列的称呼。微生物测序量很少，一般4M reads就就可以了，但是对于高通量测序仪来说一条lane能出几十G甚至上百G的数据，所以不可能一条lane只测一个样品，因此会给不同的样品加上不同的index或者barcode，进行混库测序；最后数据出来了，就可以根据不同的index信息把reads...
什么是基因二代测序?
第二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序（Sequencing by Synthesis），即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列，现有...
测序相关知识总结
该学科提供基因组信息以及相关数据系统利用,试图解决生物,医学,和工业领域的重大问题。 什么是DNA甲基化 DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。正常情况下,人类基因组“垃圾”序列的CpG二核苷酸相对稀少,并且总是处于甲基化状态,与之相反,人类基因组中...
如何定量分析免疫组化和western blot 的结果,求具体步骤
首先在这里明确两个名词翻译:“Lane”指电泳泳道;“Band”指电泳条带。在下文中一律使用这两个英文名词来表示这两个意思。 电泳条带的识别:和前面研究Lane一样,首先我们要对Lane上的Band进行识别。识别方式同样分为自动识别和人工识别。自动识别的时候选择“Band-Detect Bands...”命令。这时Quantity One会自动...
KD是什么单位啊?
回答：KD指标：全称KDJ指标，中文名称是随机震荡指数，英文名称是Stochastics oscillator是技术分析指标的一种，最早起源于期货市场，是在WMS的基础上发展起来的。延伸：KDJ指标的中文名称是随机指数，最早起源于期货市场。随机指标(KD)自50年代由美国大师乔治.雷恩（George C. Lane）博士创立以来，历经半世纪...
s-SNOM应用范围是什么
纳米线和纳米颗粒 聚合物和蛋白质 从可见光到兆赫兹的宽光谱范围内，Nea SNOM可以对各 类物质性质进行扫描，分辨率达到纳米级别，例如：化学组成 晶体结构 机械压力\/张力 辐射损伤 载流子浓度及迁移 电场分布 无论是描绘半导体纳米棒中载流子的分布、定量单晶体管 内的掺杂浓度、探索聚合物混合物的形态还是...
