如何确定基因中的内显子和外显子?

测定出了某个基因的全序列后,如何才能确定这段基因所包含的内含子和外显子分别有多少个?以及他们的位置如何?请教高手!

1、进入NCBI,search下拉框中选择Gene,for后输入你的基因名称。然后在显示的结果中选择与你要研究基因相符的那个。然后在Genomic regions, transcripts, and products下有个模式图,点击上面的的编号如:NC_00…会出现Links. 选择GENEBANK。 在新界面中有mRNA,join后括号里面的就是外显子。点击外显子的ID,就会看到外显子exon的具体信息。

2、进入UCSC,http://genome.ucsc.edu/。点击左侧Genome Browser,在position or search term输入你的基因名称。会出现模式图,上面会有几条线,你放在上面会显示它代表什么。单击代表基因的那条线,在mRNA/Genomic Alignments下面点击View details of parts of alignment within browser window.然后block代表外显子。

祝你好运!
温馨提示:内容为网友见解,仅供参考
第1个回答  2009-10-19
内含子 外显子的序列的首尾有特殊的保守序列。

如何识别外显子和内含子?
1. 外显子捕捉技术是通过构建特定的载体,用于从插入片段中识别并回收外显子序列,以便克隆目的基因。2. 捕捉外显子的载体,如pETV-SD,是一种能在不同生物系统中复制的穿梭载体,例如大肠杆菌和酵母、细菌以及哺乳动物细胞。3. 基因在转录后经历RNA剪接过程,这需要剪接供体(SD)位点和剪接受体(SA...

如何识别内含子与外显子
外显子是编码序列,内含子不参与编码,会在转录过程中的加工去除。内含子和外显子的分界线在于:GUAG法则。即每个内含子的开始两个碱基都是是GU,或GT,最后两个是AG。内含子:断裂基因的非编码区,可被转录,但在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。内含子可能含有“旧码”,...

如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构图
如何进行基因中外显子和内含子的分析1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.3、如...

怎么得到一个基因的内含子,外显子
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中...

如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构图
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中...

基因中的内含子与外显子有什么区别?
1、外显子是编码区内的有效编码序列,内含子是编码区中的非编码序列。2、外显子就是在成熟mRNA中保留下的部分,也就是说成熟mRNA对应于基因中的部分,而内含子是指在mRNA加工过程中被剪切掉的部分,在成熟mRNA中不存在的部分。3、外显子和内含子是存在于真核细胞中,外显子就是要表达的序列,内含...

外显子和内含子的定义
外显子:基因组DNA中出现在成熟RNA分子上的序列.外显子被内含子隔开,转录后经过加工被连接在一起,生成成熟的RNA分子.内含子:真核生物细胞DNA中的间插序列.这些序列被转录在前体RNA中,经过剪接被去除,最终不存在于成熟RNA分子中.内含子和外显子的交替排列构成了割裂基因....

外显子和内含子的定义
内含子则是真核生物细胞DNA中的一个特性,它们位于基因序列中,但并不被转录成成熟RNA。在转录过程中,内含子会被转录进前体RNA中,但随后在剪接步骤中被移除,因此它们不会出现在成熟RNA分子中。内含子与外显子的交替排列,共同构成了基因的割裂结构,也被称为“间插序列”。总的来说,外显子和内含...

NCBI如何确定基因的外显子和内含子?
事实上,在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子,当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。操作步骤如下:1.在Gene数据库,填入基因名HNF-4,我一般的话习惯叫Symbol,每个基因都有个Symbol,即基因名。2.我们来mouse的...

在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子?
在NCBI数据库中寻找基因的外显子和内含子,可以通过多种途径实现,其中一种方法是利用Splign工具。以下是具体的操作步骤:首先,登录NCBI的Gene数据库,搜索你感兴趣的基因,例如HNF-4。在搜索框中输入基因的Symbol,也就是基因的名称。每个基因都有独特的Symbol,它会随着版本更新而变化,但GeneID始终不...

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