怎么确定一个基因有多少内含子多少外显子

如题所述

在NCBI上的OMIM数据库输入基因名,在TITLE上就会显示它的学名。

用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ENSEMBL找基因,显示其外显子和内含子。进入ENSEMBL的方法有两种,1.NCBI上进入基因的检索条以后,summary里会有相应的ENSEMBL的链接(see related);2.直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后,点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息,包括外显子和内含子的注释,5‘和3’UTR的注释,和密码子的注释。
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第1个回答  2020-12-14
在NCBI上的OMIM数据库输入基因名,在TITLE上就会显示它的学名。

用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ENSEMBL找基因,显示其外显子和内含子。进入ENSEMBL的方法有两种,1.NCBI上进入基因的检索条以后,summary里会有相应的ENSEMBL的链接(see related);2.直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后,点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息,包括外显子和内含子的注释,5‘和3’UTR的注释,和密码子的注释。

怎么得到一个基因的内含子,外显子
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中...

怎么知道基因有多少外显子和内含子
在一些基因数据库网站上,已经有预测的数据可以查,比如NCBI,EBI,另外,转录成成熟RNA的时候会把内含子切掉,这样只要在CDNA里面找就可以知道外显子上有多少个酶切位点了

在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子?
在搜索结果中,你可以查看HNF4基因的结构图,它会清晰地显示该基因有10个外显子,用蓝色标记的UTR区域分别位于5'端和3'端。UTR区域包含非编码序列,对基因的功能有一定影响。接着,进入HNF-4基因的RefSeq区域,这里提供了该基因的参考序列,包括mRNA和基因组版本。通常,以NM_开头的序列是公认的参考序...

NCBI如何确定基因的外显子和内含子?
事实上,在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子,当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。操作步骤如下:1.在Gene数据库,填入基因名HNF-4,我一般的话习惯叫Symbol,每个基因都有个Symbol,即基因名。2.我们来mouse的HN...

如何确定一个基因所含有的内含子的数目和大小?
将该基因的基因组DNA与成熟的mRNA进行比较,在成熟mRNA中不存在的片段就是内含子。第一个转酯反应由一个游离的鸟苷或鸟苷酸(GTP、GMP或GDP)介导,其3‘-OH作为亲核基团攻击内含子5’端的磷酸二酯键,从上游切开RNA链。在第二个转酯反应中,上游外显子的自由3‘-OH作为亲核基团攻击内含子3’位...

如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构图
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中...

如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构图
首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.3、如你需要完整的基因序列,...

如何识别内含子与外显子
内含子和外显子的分界线在于:GUAG法则。即每个内含子的开始两个碱基都是是GU,或GT,最后两个是AG。内含子:断裂基因的非编码区,可被转录,但在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。内含子可能含有“旧码”,在进化过程中丧失功能的基因部分。外显子:断裂基因中的编码序列,是...

如何进行基因中外显子和内含子的分析
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中...

如何确定基因中的内显子和外显子?
1、进入NCBI,search下拉框中选择Gene,for后输入你的基因名称。然后在显示的结果中选择与你要研究基因相符的那个。然后在Genomic regions, transcripts, and products下有个模式图,点击上面的的编号如:NC_00…会出现Links. 选择GENEBANK。 在新界面中有mRNA,join后括号里面的就是外显子。点击外显子...

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