如何确定基因中的内显子和外显子?
1、进入NCBI，search下拉框中选择Gene，for后输入你的基因名称。然后在显示的结果中选择与你要研究基因相符的那个。然后在Genomic regions, transcripts, and products下有个模式图，点击上面的的编号如：NC_00…会出现Links. 选择GENEBANK。 在新界面中有mRNA，join后括号里面的就是外显子。点击外显子...
UCSC基因组上染色体图怎么看
最顶上显示该基因在染色体的位置（红竖线表示）接下来的是该基因的图谱，黑块代表外显子，线条代表内含子。如果继续点击，可以一直放大到核苷酸序列水平。下面的部分是其他物种的同源序列。再下面的箭头可以左右移动中点位置
转录因子序列在ncbi如何查找?
建议用UCSC genome browser看外显子等，比较直观 根据你现有水平，还是到UCSC比较好。NCBI比较复杂，建议稍熟悉这类数据后再用。http:\/\/genome.ucsc.edu。然后输入你要查的基因名字。就这么简单。然后点击出来的图，或者可以指定某个位置。外显子，内含子都是标好的。
2022-03-16引物设计及在线验证
step5:进一步验证:由于设计引物时跨越了内含子,且已经提醒我是上游引物跨越了内含子,于是我进入NCBI-Nucleotide 输入:Syt4 Mus musculus mRNA,点击搜索,然后点击左边栏目中的mRNA,然后点击第一条...参考以上2.1步骤,寻找这个基因的CDS序列,找到CDS序列后,搜索这两条上下游引物,发现在CDS区域中,且这对引物的PCR产物...
如何查找一个基因的启动子序列
对于Known Genes（已知基因）和预测的基因路径来说，一般的惯例是以一个高的垂直线或块状表示每个编码外显子，以短的垂直线或块状表示5′端和3′端非翻译区。起连接作用的内含子以非常细的线条表示。翻译的方向由沿着细线的箭头指示。Known Genes来自LocusLink内的mRNA参照序列，已经利用BLAT程序将这些序列...
做序列比对,这个工具最好用!
结果显示，目标序列属于cDNA序列，包含ACE2基因的三个外显子的部分序列，没有内含子对应的序列。点击不同的快捷链接，可以快速切换并显示相关信息。在Genomic chrX (reverse strand)栏，显示了200bp目标序列对应的基因组序列的详细信息，包括外显子碱基序列、内含子区域的完整序列及其在染色体上的物理位置。...
CHIP-Seq(7):对peak进行注释和可视化
genomic annotation注释：annotation列，注释的是peak的位置，它落在什么地方了，可以是UTR，可以是内含子或者外显子 nearest gene annotation（最近基因）注释：多出来的其它列，注释的是peak相对于转录起始位点（TSS）的距离，不管这个peak是落在内含子或者别的什么位置上，即使它落在基因间区上，都能够...
氨基酸与DNA的关系
其实对于真核细胞来说，外显子和内含子的关系并不是完全固定不变的。有事同一条DNA链上的某一段DNA序列，当它作为编码某多肽链的基因时是外显子，而作为编码另一多肽链的基因时，则是内含子，结果是同一基因可以同时转录为两种或两种以上的mRNA。（我在书上看到的！）一般来说，如果要计算的话，...
遗传解读工作中如何选择转录本的使用及如何查找相关转录本?
转录本的奥秘<\/转录本，是基因通过转录过程产生的不同成熟mRNA剪接体，它们源于基因的内含子与外显子的组合方式。在真核生物中，选择性剪接是主要的多样性来源，通过调控外显子的组合，可产生具有不同功能的蛋白质。此外，启动子选择性使用、选择性起始和核糖体移码也贡献了基因多样的转录本谱。在遗传...
如何进行DNA的结构分析
http:\/\/blast.ncbi.nlm.nih.gov\/Blast.cgi 选择nucleotide blast。检索吧。然后结果中选择关联度最好的，你就可以进去看到结果了。一般来说，如果你知道你提取的DNA来自哪个物种，就直接选择结果中那个物种的相关序列。结果里有完整的DNA序列。有了序列，氨基酸序列就自然有了。在结果里“ CDS ”下就...
