实时荧光定量RT-PCR的Fold change怎么计算
处理所致倍数变化(fold change)= C(A-E)\/D(F-B)扩增效率(E)=10-1\/斜率(理想的PCR扩增效率=2)百分比表示为:e%=(E-1)×100 同时是上面例子,如果Cdk5的扩增效率是70%;GAPDH的扩增效率是95%,那么处理所致的倍数变化(fold change)应该是 =(1.7)(25-22.1)\/(1.95)(18.3-18.2...
实时荧光定量RT-PCR的Fold change怎么计算
荧光定量PCR中,1个Ct值代表2倍变化。所以你求出相对control的Ct值变化x后,2指数x就是倍数变化的量。
rt-pcr△ct是负值怎么分析
将每一组样本每一个目的基因的△Ct都算好,整理进Excel,用本次实验中待研究样本的△Ct减去对照组样本的△Ct,并同时对所有结果取相反数,该步运算得到的结果就是-△△Ct。最后,对-△△Ct进行2的幂运算,即2^-△△Ct就得出Fold Change。
数据挖掘中的LogFC,p值和FDR值是什么?
当expr(A) > expr(B)时,B对A的fold change就小于1,log2 fold change就小于0。通常为了防止取log2时产生NA,我们会给表达值加1(或者一个极小的数),也就是log2(B+1) - log2(A+1)。假设A表达为1,B表达为8,C表达为64;直接用差B相对A就上调了7,C就相对B上调了56;用log2 fol...
实时荧光定量RT-PCR的Fold change怎么计算
该标准品可以是纯化的质粒DNA,体外转录的RNA,或者是体外合成的ssDNA。相对定量可以分为比较Ct法和其他一些相对方法。比较Ct指的是通过与内参基因Ct值之间的相差来计算基因表达差异,也称之是2-DDCt。3.1绝对定量从标准曲线获得线性方程:Y=-3.432X+34.638;R2=0.995,E=95%,所以可以进行数据分析。